O objetivo do desenvolvimento da pesquisa na EEUSP define-se pela geração de novos conhecimentos, testes de teorias e orientação para aplicação do conhecimento produzido na prática.
Essas atividades são orientadas pela Comissão de Pesquisa que tem como responsabilidade estabelecer o Plano Diretor relativo às Linhas de Pesquisa, estimular o desenvolvimento de pesquisa de boa qualidade, visando a melhor ia da qualidade da assistência e do ensino de enfermagem e a manutenção de uma Pós-Graduação de excelência. Com a finalidade de promover e favorecer a construção do conhecimento em Enfermagem e coordenar as atividades de pesquisa a Comissão organiza e mantém um banco de dados sistematizado de projetos e sub-projetos de pesquisa queinclui o cadastro de pesquisadores, bolsistas, instituições financiadoras e publicações; mantém um sistema de referência relativo às agências financiadoras e busca promover programas de pós-doutorado.
A iniciação científica tem se constituído em atividade prioritária, com inserção cada vez maior de graduandos no desenvolvimento de investigações científicas.
A evolução quantitativa das bolsas do Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica (PIBIC) do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) vem se mantendo positiva nos últimos dez anos, aumentando de 4 para 52 bolsas no periodo de 1992 a 2011.
Há 55 grupos de pesquisa, liderados por docentes, que desenvolvem Linhas de Pesquisa primordialmente articuladas às áreas assistencial e organizacional, as quais estão vinculadas às áreas de concentração dos Programas de Pós-Graduação.
